水利与土木工程学院源于1958年创办的东北农学院农田水利工程专业，后发展成为东北农业大学工程学院水利系，2000年11月正式组建成立。2016年9月，经省人社厅批准，更名为水利与土木工程学院。学院成立以来不断发展壮大，已经成为黑龙江省水利高等教育的优势力量。
学院现有全日制本科生1941人，研究生274人（含外国留学生4人）。学院教风、学风优良，在水利类专业青年教师讲课竞赛、黑龙江省高校教师教学创新大赛、黑龙江省高等学校课程思政教学竞赛、校级教师教学技能大赛、全国混凝土设计大赛、全国大学生水利创新设计大赛、全国大学生农业水利工程及相关专业创新设计大赛、黑龙江省结构设计竞赛、“创青春”中国青年碳中和创新创业大赛、中国研究生“双碳”创新与创意大赛等各类竞赛中屡获佳绩；拥有国家级一流本科课程1门、省级精品在线开放课程1门、省级一流线上线下混合式课程1门、黑龙江省线下一流课程1门、省级高等学校课程思政示范课程2门、校级精品课8门、校级精品在线课程6门、校级“课程思政”试点课程14门；省级研究生导学思政团队1个；先后主持教学课题30余项；发表教学论文50余篇；出版全国统编教材28部；获得黑龙江省高等教育教学成果一等奖1项、高等学校水利类专业教学成果一等奖等教学奖励30余项。拥有几十家稳定的就业基地，毕业生基本功扎实、能力突出、作风优良，深受用人单位好评，就业率始终名列学校前茅，多次荣获校级与省级就业工作先进集体荣誉称号。
全院教职员工105人，师资力量雄厚。专任教师79人，实验技术人员11人；教授21人，副教授27人，讲师31人，高级工程师6人；博士79人，硕士92人；博导24人，硕导47人。拥有国务院学位委员会学科评议组成员、国家杰出青年科学基金获得者、科技部“中青年科技创新领军人才”1人、国家级重大人才工程入选者3人、国家优秀青年科学基金获得者1人、国家优秀青年科学基金（海外）获得者1人、享受国务院政府特殊津贴人员、教育部新世纪优秀人才支持计划入选者1人、农业农村部“神农青年英才”2人、“龙江学者”特聘教授1人、“龙江学者”青年学者1人、黑龙江省“头雁”团队骨干成员1人、黑龙江省杰出青年科学基金获得者3人、黑龙江省自然科学基金优秀青年项目获得者10人、黑龙江省青年科技奖获得者5人、黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划入选者7人、东农学者计划入选者35人；省级教学名师1人、省级青年教学名师1人；兼任国家、省级学会副理事长、副主任委员、委员等20余人，《水科学进展》、《农业工程学报》等10余种学术期刊编委。
学院具有培养多层次专业人才的能力，专业特色鲜明，学科优势明显，是省内唯一同时具有学士、硕士、博士3级学位授予权的水利类学院。设有农业水利工程（中国工程教育专业认证协会认证专业、国家级一流本科专业建设点、国家首批卓越农林人才教育培养计划改革试点项目入选专业、国家级新工科研究与实践项目入选专业）、水利水电工程（中国工程教育专业认证协会认证专业、黑龙江省一流本科专业建设点）、水文与水资源工程（黑龙江省一流本科专业建设点）、土木工程、工程管理5个本科专业，农业水土工程博士点、硕士点（省级领军人才梯队、省级重点学科）、水利工程一级学科硕士点（省优势特色学科）、土木水利专业学位硕士点；设有青年教师企业实践工作站3处，拥有省级科技小院4 个、省级研究生产教融合工作站2 个、校级寒区水利工程现代产业学院1个；拥有教育部寒地黑土生境健康国际合作联合实验室、农业农村部农业水资源高效利用重点实验室、黑龙江省寒区水资源与水利工程重点实验室、黑龙江省智能土壤联合实验室（国际合作）、黑龙江省高校节水农业重点实验室、国际持久性有毒物质联合研究中心，东北农业大学A类学科团队3个、C类学科团队3个；设有水利水电工程等成人继续教育站点。
学院紧密结合国家特别是黑龙江省水利科技发展需求，在寒区农业水资源演变机理与水文过程模拟、寒区水利工程安全与冻害防治技术、寒区农业节水技术与装备、黑土区农田水土环境演变机制与调控等方面取得了突出成绩。先后主持完成国家杰出青年科学基金、国家自然科学基金区域联合基金重点项目、国家优秀青年科学基金、国家优秀青年科学基金（海外）、国家重点研发计划课题、国家自然科学基金面上青年等各类科研项目200余项，累计获得科研经费7000余万元；发表学术论文800余篇，SCI、EI收录500余篇；出版专著20余部；获得黑龙江省科学技术一等奖2项、二等奖14项、三等奖7项、国家环保科技二等奖1项、化学领域全球十大新兴技术奖1项；申请专利、软件著作权100余件，为黑龙江省农业可持续发展提供了强有力的水利科技支撑。
学院依托自身优势，通过承担流域规划、高科技农业园区规划、末级渠系改造、土地整理、水土保持规划、黑龙江省水稻节水控制灌溉技术培训、哈尔滨市水务局非水利专业干部培训、寒区水工建筑物稳定性关键技术、黑龙江省水文图集修编及省内水利系统科研、工程项目咨询论证等项目，服务于黑龙江省乃至我国北方寒区的农业生产实践，为区域社会经济可持续发展做出了重要贡献。
学院围绕“立德树人”的根本任务，扎扎实实提高人才培养质量，打造了一支优秀的教师队伍，荣获“黑龙江省教育系统师德先进集体”、黑龙江省教育系统“教书育人管理育人服务育人”先进集体、黑龙江省公办高校党建“样板支部”、“黑龙江省五一劳动奖章”、“黑龙江省高等学校师德先进个人”、“省级教学名师”、“省级青年教学名师”、“哈尔滨市三八红旗手标兵”、校“师德师风先进集体”、校“五四青年奖章”、校“三育人先进个人”、校“教学先锋岗”、校“优秀教师”、“校级教学名师”、“校级青年教学名师”、校“文明单位标兵”、校“优秀共产党员”、校“优秀党务工作者”等荣誉称号。
面向未来，学院将立足龙江，坚守教书育人初心、践行振兴水利使命，以人才培养为中心，以学科建设为龙头，全面提升学科专业排名及学院综合竞争力，建设“国内一流、国际知名”的品牌水利学院，在黑龙江省农业农村现代化建设新征程中做出新的贡献
